Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK17Q00537 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms