Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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FAM3AP98173 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FAM3AP98173 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FAM3AP98173 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FAM3AP98173 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FAM3AP98173 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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FAM3AP98173 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FAM3AP98173 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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