Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
IRX1P78414 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
IRX1P78414 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IRX1P78414 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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