Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RPS3AP61247 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS3AP61247 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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