Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVFC1-1P60608 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms