Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBP50607 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBP50607 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBP50607 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBP50607 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBP50607 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBP50607 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBP50607 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms