Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.8 ms