Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRBP23467 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms