Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRFP10586 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRFP10586 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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