Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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