Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOD2P04179 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms