Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms