Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRPF3Q9ULD4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms