Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM54Q9BYV2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM54Q9BYV2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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