Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BBS2Q9BXC9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BBS2Q9BXC9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms