Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KATNB1Q9BVA0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms