Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GORASP1Q9BQQ3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms