Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
RETNLBQ9BQ08 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms