Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM47Q96LD4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms