Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GTF3C6Q969F1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF3C6Q969F1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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