Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTTNBP2Q8WZ74 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms