Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ZNF548Q8NEK5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF548Q8NEK5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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