Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ATG16L2Q8NAA4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ATG16L2Q8NAA4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms