Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SVOPQ8N4V2 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms