Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BHLHA9Q7RTU4 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms