Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRIG3Q6UXM1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIG3Q6UXM1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms