Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC174Q6PII3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms