Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8B1Q6J4K2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms