Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC93Q567U6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms