Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM71Q2Q1W2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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