Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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RTL8BQ17RB0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RTL8BQ17RB0 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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