Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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