Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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E2F4Q16254 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F4Q16254 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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