Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC85BQ15834 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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