Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms