Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PDCD1Q15116 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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