Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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LAPTM4AQ15012 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LAPTM4AQ15012 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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