Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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FAM53BQ14153 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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