Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DDX39BQ13838 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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DDX39BQ13838 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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