Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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