Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
FHL3Q13643 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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