Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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