Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ACACAQ13085 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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