Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTP4A2Q12974 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTP4A2Q12974 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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