Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DSC1Q08554 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms