Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms