Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMARCA4P51532 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms