Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NESP48681 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NESP48681 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NESP48681 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NESP48681 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NESP48681 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms