Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
BRCC3P46736 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRCC3P46736 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms