Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USP5P45974 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USP5P45974 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USP5P45974 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms